Voor veel gebruikers zijn USB-sticks het ideale middel om een doel te bereiken: USB-sticks zijn klein, goedkoop en bieden veel opslagruimte. Geen wonder dat er steeds minder cd's en dvd's worden gebrand. Maar als het gaat om het formatteren van een USB-stick, zijn er een paar dingen om te overwegen
In de regel moet u uw USB-sticks formatteren met het FAT32-bestandssysteem: dit bestandssysteem wordt niet alleen herkend door Windows 7, Windows Vista en Windows XP, maar ook door computers met Mac OS X en Linux.
Het nadeel van FAT32 is echter dat een bestand niet groter mag zijn dan 4 gigabyte. Hoewel deze hindernis relatief moeilijk te overwinnen en gemakkelijk te omzeilen is, is een andere tekortkoming veel belangrijker: USB-sticks kunnen een maximale opslagcapaciteit van 32 gigabyte hebben als ze met FAT32 moeten worden geformatteerd. USB-sticks met een opslagcapaciteit van meer dan 32 gigabyte zijn momenteel nog relatief duur, maar de prijzen blijven dalen, dus u moet rekening houden met deze maximale grootte.
ExFAT kent geen beperkingen aan bestandsgroottes of de algemene opslagcapaciteit van een USB-stick: Microsoft introduceerde dit bestandssysteem met Windows 7, zodat ExFAT alleen standaard door Windows 7 wordt ondersteund. Aan de andere kant heb je onder Windows Vista Service Pack 1 nodig, waarmee ExFAT-ondersteuning wordt geüpgraded. Microsoft heeft een aparte update voor Windows XP uitgebracht zodat USB-sticks met ExFAT als bestandssysteem gebruikt kunnen worden: http://support.microsoft.com/kb/955704
Aan de andere kant zouden we FAT volledig afraden: dit bestandssysteem is nu verouderd, dus u moet het niet langer gebruiken. NTFS heeft ook een aantal nadelen, omdat systemen met Mac OS X als besturingssysteem dergelijke USB-sticks over het algemeen wel kunnen lezen, maar er geen bestanden naar kunnen schrijven.